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在一項新的研究中,來自美國康奈爾大學(xué)、弗吉尼亞大學(xué)、特拉華大學(xué)、密蘇里大學(xué)、德國歐洲分子生物學(xué)實驗室和奧地利科技學(xué)院的研究人員提供了HIV-1病毒結(jié)構(gòu)是如何組裝的新細(xì)節(jié),這一發(fā)現(xiàn)為治療這種病毒感染提供了潛在的新靶標(biāo)。
為“Inositol phosphates are assembly co-factors for HIV-1”。這項研究報道一種在哺乳動物細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的被稱作肌醇六磷酸(inositol hexakisphosphate, IP6的小分子在這種病毒的未成熟發(fā)育(在被感染的細(xì)胞內(nèi)發(fā)生)和成熟發(fā)育(在這種病毒從細(xì)胞膜上出芽并從細(xì)胞上切割下來后發(fā)生)中起著關(guān)鍵作用。
論文作者、康奈爾大學(xué)博士后研究員Robert Dick說,“這種小分子在HIV-1組裝通路的兩個不同的步驟中發(fā)揮著作用。”Dick在論文資深作者、康奈爾大學(xué)分子生物學(xué)與遺傳學(xué)系教授Volker Vogt的實驗室里從事研究工作。 在HIV-1的未成熟發(fā)育和成熟發(fā)育階段,IP6在形成蛋白晶格結(jié)構(gòu)的通路中起著關(guān)鍵作用。當(dāng)這種病毒在細(xì)胞內(nèi)發(fā)育時,它有助于組裝未成熟的晶格。這種未成熟的晶格在這種病毒出芽后會遭受降解從細(xì)胞膜上切割下來。在此期間,IP6還促進(jìn)一種成熟的蛋白晶格在這種病毒顆粒內(nèi)組裝。
在這項研究中,這些研究人員純化出一種被稱作Gag蛋白的結(jié)構(gòu)蛋白,并將它與一種充當(dāng)模板的核酸混合在一起,這會形成一種在未成熟發(fā)育階段發(fā)現(xiàn)的病毒蛋白晶格類型。Dick及其同事們利用染色劑和電子顯微鏡觀察了網(wǎng)格上的圓形病毒顆粒(基本上僅是病毒蛋白晶格)。
這些研究人員在存在和不存在IP6的情況下重復(fù)了Gag蛋白、核酸和緩沖液之間的組裝反應(yīng)。Dick說,“前幾個實驗告訴我們,我們觀察到的東西是非常引人注目的。IP6的存在極大地增加了我們能夠檢測到的病毒顆粒數(shù)量。”
盡管如此,這些研究人員還是不確定IP6在Gag蛋白上的何處發(fā)揮作用來產(chǎn)生影響,因此他們構(gòu)建出不同的Gag蛋白版本并縮小活性位點,旨在預(yù)測IP6小分子在何處發(fā)揮作用從而產(chǎn)生晶格結(jié)構(gòu)。
在這時,這些研究人員與弗吉尼亞大學(xué)分子生理學(xué)與生物物理系的論文共同作者Owen Pornillos和Barbie Ganser-Pornillos進(jìn)行了接觸,其中Pornillo和Ganser-Pornillos獲得了IP6分子與Gag蛋白相互作用時的晶體學(xué)數(shù)據(jù)。在HIV-1病毒成熟發(fā)育階段,這些研究人員發(fā)現(xiàn)IP6在將這種病毒顆粒從細(xì)胞上切割下來后暴露出來的位點上發(fā)生相互作用。在此期間,一種全新的由不同的蛋白組成的晶格(而不是未成熟的晶格)產(chǎn)生了。 這些研究結(jié)果為開發(fā)潛在的新療法打開了大門。一種策略是人們開發(fā)或鑒定類似于IP6并結(jié)合到與IP6相同的位點上的藥物,從而阻斷這種小分子并阻止這種病毒成熟。Dick說,“一個細(xì)胞能夠產(chǎn)生數(shù)百萬個病毒顆粒,但如果這些病毒顆粒不經(jīng)歷這種成熟發(fā)育過程,那么它們就沒有傳染性。
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